01、关于如何保管遗体、怎样妥善处置捐献者遗体，《条例》缺失具体方法，因此，目前一些捐献者遗体在使用后未能得到妥善处置。这让很多捐赠遗体的家属心寒，也让很多有意愿捐赠遗体的人望而却步。

02、很多遗体捐赠者未在生前就此事与其家人达成共识，导致相关工作人员在接受遗体时因为家属的阻挠困难重重，甚至有工作人员无故被殴打的恶劣事件发生。对我国公益事业的发展有一定的影响。

03、很多遗体捐赠者不被家人所理解，认为“身体发肤受之父母”，死后也因遗体被捐赠不能带回老家安葬。成为“孤魂野鬼”。

04、一些思想传统落后的农村地区不明白情况，认为是亲属将捐赠者的器官卖掉，或者是捐赠者在外做了亏心事才“死无全尸”。正所谓人言可畏，给遗体捐赠者家属也造成麻烦。