实际上，《超级战舰》是一部有些混乱的科幻小片。将其描述为与海战版的《变形金刚》，实在是夸大其辞。说是另外一个版本的《洛杉矶之战》还差不多，但实际上还不如《洛杉矶之战》好。
　　
　　而无论从制作规模，还是演员阵容上，甚至是故事的套路上，《超级战舰》与《洛杉矶之战》都颇有相似之处。虽然觉得《洛杉矶之战》的故事有些扯，但起码还算流畅。而《超级战舰》中则加入了太多想表达的东西，于是反倒使得故事上都有些凌乱了。
　　
　　从男主人的线索上，一个总是惹是生非的海军战士，到成为挽救整个世界的英雄。这明显是好莱坞一拍再拍的美国英雄的路数。英雄不完美，但足够有勇气，也足有有担当，有人性光辉的英雄，影评网是典型的励志哥套路，也符合美国梦的模式。而从他的爱情线索上，则英雄加公主，属于延续了数千年的套路，屌丝吊女神，几经坎坷，终将抱得美人归。
　　
　　以上两条线索被杂糅在一起，实际上是有些牵强的，或者多有些生硬。为何《洛杉矶之战》的故事流畅，就是直接咔擦掉了爱情的成分，演变成单纯的战争故事。而《变形金刚》好看，是没有让人类作为完全的主角，作为配角，然后怎么插科打诨都并不太碍于主题。何况人类还负责了故事的承传起合，不仅将汽车人之间的战争很好地结合了起来，而且还顺便做到了调节气氛，负责撩拨人小神经的搞笑责任。而反观《超级战舰》，将故事转移到主线上，即人类战舰与外星人的战舰之间的战争。实际上，负责对抗的并不是人类战舰与宇宙战舰，还是人与人的关系，地球人与外星人。但对于两者的关系，电影处理的相当混乱。
　　
　　首先是人类向外太空发射信号，从而招来了外星人的光临。在外星人到访地球的过程中，外星舰队中负责通讯的飞船居然意外撞到了人类发射的卫星上。于是外星人到了地球之后，必须要寻找人类的通讯设备，以便能够重返外太空。而且这些外星人并没有停在地球的陆地上，而是躲到了太平洋之中。却不料，悲催的他们再次遭遇意外，美国的舰队正在进行军事演习，而且就是外星人所在的水域。并且遭到了人类的主动袭击。
　　
　　如果说外星人想要消灭地球，其实以他们的科技实力，几乎是轻而易举的事。但他们却没有主动这么做，而是进行防御，而且只要地球人不对其进行进攻，就绝不主动进攻。对于没有进攻能力的人类，也是绕道而行。他们的所为，只是去找到可以利用的通讯设备而已。这样的设置，很像是《第九区》。但故事中他们又莫名其妙地对人类的都市放出了几个风火轮，而且专挑人类的弱点进行主动攻击。而且片子还借人类之口，说是外星人想要消灭地球。但这实在有些过不过去。这种设计逻辑的混乱，可以理解的角度只能是为了增加片子的可看性，为了复杂而复杂。
　　
　　从战场上人类的角度，几乎跟《洛杉矶之战》一样，人类的大部队无法参与战争，《洛杉矶之战》中是人类的大部队被消灭掉了，只有一只小分队意外存留，而且要靠他们去摸到外星人的老巢，痛击其核心装置，然后将整个外星人一举搞掂。有点扯，但也勉强说得过去。在《超级战舰》中，人类的大部队也是无法参战，因为一个奇大的音障使得大部队无法进入战争区域，能够参战的只有三条驱逐舰，而且其中的两只在起始阶段便已被消灭，仅余的一条唯有进行周旋，伺机而动。最后还是被外星人干掉。而最终的希望，居然寄托到了一条已经退役70年的二战时期的老战舰，即密苏里号之上。故事到了这里，或许美国人会兴奋起来，而我与我身边的几个哥们看了，一致觉得急转直下。因为最后的结局肯定是人类要赢的，但如此地去赢，实在是太扯蛋了。向美国老军人致敬如此，还不是征兵广告是什么？且不说，作为博物馆的密苏里号哪来的那些弹药。
　　
　　一部剧情上千疮百孔的科幻片，要想让人看得有多兴奋，使得是不太好完成的任务。