国家最高科学技术奖设立于2000年。国家最高科学技术奖于2000年正式设立，每年评选一次，每次授予不超过两名，由国家主席亲自签署、颁发荣誉证书、奖章和奖金。

国家最高科学技术奖是中国五个国家科学技术奖中最高等级的奖项，是对广大科技工作者的鼓励。

国家最高科学技术奖正式设立后，在2004年，国家最高科学技术奖第一次出现空缺，2015年第二次出现空缺。

截至2021年11月，共有35位杰出的科学工作者获得了国家最高科学技术奖，他们为中国科技发展不断做出新的贡献。