2个。北京松山国家级自然保护区和北京百花山国家级自然保护区。北京松山保护区位于北京市延庆区海坨山南麓，地处燕山山脉的军都山中，总面积4671公顷。北京百花山保护区地处北京西部，位于北京市门头沟区清水镇境内，占地总面积为21743.1公顷。

中国大陆的国家级自然保护区的命名法大多数为“省名 地名 (保护对象名) 国家级自然保护区”的“双名法(三名法)”

长江上游珍稀、特有鱼类国家级自然保护区是一个地跨四川、贵州、云南、重庆等三省、一直辖市的国家级自然保护区。

宁夏回族自治区、内蒙古自治区分别建有宁夏贺兰山国家级自然保护区、内蒙古贺兰山国家级自然保护区。