牡丹江高铁站和火车站是在一起的。牡丹江高铁站和火车站即牡丹江站，是黑龙江省铁路客运重要枢纽之一，是哈牡高速铁路的终到站，也是沈佳高速铁路的主要车站。丹江站的主要线路包括滨绥铁路、图佳铁路、哈牡高速铁路、沈佳高速铁路、牡绥高铁等。

牡丹江站始建于1901年。1990年6月15日，牡丹江站新站舍破土动工，1991年9月15日竣工。2016年初，牡丹江站综合改造项目全面开工。

截至2018年9月，牡丹江站设有8台17线，站房总面积2.9万平方米(不含北站房)，设计承载量为年发送旅客502.7万人次。