第1集
1927年“四一二”事变爆发，死里逃生的芦焱遇到了一群准备刺杀屠先生的人。国民党的势力分为两派，屠先生掌管的军统和若水先生掌管的中统。芦焱加入了刺杀活动，但是因种种原因没能杀死屠先生。芦焱因刺杀屠先生而有名，被称为“红先生”。8年后，一心想加入共产党的他阴差阳错地来到了一棵树——一个离延安最近的地方，被两个蒙面人稀里糊涂的塞了一包种子。蒙面人之一便是其后一直照顾芦焱的共产党种子诸葛骡子。西安事变爆发后，屠先生的唯一接班人时光带着得力手下门栓等人来到了最靠近延安的地方，他打垮了大砂锅的马匪团伙，自己做起了大砂锅的头号马匪。大砂锅被两伙人控制，一拨是军统屠先生的接班人时光掌管的天外山，另一拨则是中统若水先生的亲信高泊飞掌管的黄沙会。
第2集
1941年的上海，天目山老大双车、船帮老大笑面豹和共产党老陈一起谈判，老陈想劝大家共同抗日，结果谈判破裂，老陈掩护手下岳胜离开，并叮嘱他一定要把情报带给青山。笑面豹被明为双车手下实为日本奸细的邱宗陵杀死。趁着天目山和船帮兄弟械斗之际，老陈将重要的情报发了出去。岂料这封明码电文被时光的人截了下来，得知共产党有意调动种子。芦焱化名“何先生”在一棵树当起了教书先生。双车得到情报说老陈可能就是在逃多年的“红先生”，于是双车将老陈和邱宗陵都关了起来，老陈点破了邱宗陵的汉奸身份。一棵树的村民崔百岁奄奄一息地说完最后一句“惊蛰”便撒手人寰。“惊蛰”就是种子之间的暗号，说明地下通讯网络有被连根拔起的危险了。时光发现高泊飞也在寻找种子下落，于是他决定盯着高泊飞，坐享渔翁之利。芦焱向诸葛骡子询问种子的事情，诸葛骡子告诉他，所有种子的信息只有青山知道，青山是种子的头。
第3集
由于听到惊蛰，说明上海方面出了事。芦焱想要回上海，可是需要穿过大砂锅到达两棵树之后才能到上海，路非常艰难。上海的大牢里，双车顾念与老陈的情谊，不愿意伤害老陈。老陈劝双车跟船帮兄弟和解，并说出了自己对于邱宗陵的分析。双车决定采纳老陈的建议。为了找寻种子的下落，高泊飞的黄沙会决定攻打一棵树。督教巴东来故意向芦焱教的孩子们发难。芦焱对巴东来一顿拳打脚踢。巴东来落荒而逃。诸葛骡子要芦焱交出他收藏了十三年的毒药，说是青山的吩咐。青山要所有的种子都赶快去上海。芦焱恋恋不舍的离开了一棵树，卞融让他尽快回来。共产党的援兵终于到了一棵树，在援兵的帮助下，高泊飞仓皇而去。
